Vaistų reguliarumas lėtiniam inkstų nepakankamumui ir pagrindinis mechanizmas, pagrįstas duomenų gavyba, tinklo farmakologija ir molekuliniu prijungimu

Jan 04, 2023

Santrauka:
Tikslas: Išaiškinti WU Zhao-dongo, garsaus tradicinės kinų medicinos (TCM) vyriausiojo gydytojo Jiangxi provincijoje, gydymo reguliarumą ir ištirti galimų naujų receptų prieš gydymą mechanizmą.lėtinis inkstų nepakankamumas(CRF). Metodas: buvo surinkti ambulatoriniai WU Zhao-dong receptai nuo 2019 m. liepos mėn. iki 2021 m. liepos mėn. Duomenų gavyba buvo atlikta naudojant tradicinės kinų medicinos paveldėjimo pagalbinę platformą (V 2.5), siekiant išanalizuoti vaistų vartojimo dažnumą ir vaistų asociaciją bei gauti galimus naujus receptus. Vaistų taikinių sąveika naujuose receptuose buvo ištirta Tradicinės kinų medicinos sistemų farmakologijos duomenų bazės ir analizės platformos (TCMSP), STRING ir Kioto genų ir genomų enciklopedijos (KEGG), po to buvo atliktas patikrinimas naudojant molekulinį prijungimą ir
eksperimentai. Rezultatas: iš viso buvo patikrinta 200 receptų, įskaitant 217 kiniškų vaistinių preparatų, ir gauti aštuoni nauji galimi receptai. Tiksliau, 1 receptas: Armeniacae sėkla Amarum-Astragali Radix-Platycodonis Radix-Angelicae Sinensis Radix-Smilacis Glabrae Rhizoma kepta Atractylodis Macrocephalae Rhizoma, 2 receptas: Saposhnikoviae Radix-Schizonep Radix-Schizonep
Fructus-Asteris Radix et Rhizoma-Menthae Haplocalycis Herba, Prescription 3: Armeniacae Semen Amarum-Asteris Radix et Rhizoma-Platycodonis Radix-Eriobotryae Folium-prepared Ephedrae Herba, Prescription 4:Perillae Radixa-CoodonopsisP-CohidonopsisP-Coodonopsis : Ecliptae Herba-Astragali Radix Praeparata Cum Melle-Dryopteridis Crassirhizomatis Rhizoma-Rosae Laevigatae Fructus-Coicis
Semen-Ligustri Lucidi Fructus, 6 receptas: Lycopi Herba-Lonice Raejaponicae Caulis-Trachelospermi Caulis et Folium-Alismatis Rhizoma, Prescription 7: Scutellariae Radix-Hirudo-Paeoniae Radix Rubra-Eriobotryae Radix Radix-Eriobotryae Radix-Gle,-Gscript Scrophulariae Radix-Chrysanthemi Indici Flos-Smilacis Glabrae Rhizoma- Serissae Herba. Pagal receptą buvo atrinkta 1,18 pagrindinių cheminių medžiagų komponentų. Numatyta aštuoniasdešimt 1 recepto veikliųjų komponentų taikinių ir gauti 37 galimi CRF gydymo taikiniai, įskaitant interleukiną (IL){19}}, kraujagyslių endotelio augimo faktorių (VEGF), cisteino aspartatui specifinę proteazę{21. }}(kaspazė-3), azoto oksido sintazė 3 (NOS3) ir hipoksiją sukeliantis faktorius-1(HIF-1). KEGG keliai, susiję su Kinijos vaistinių preparatų taikiniais
ir liga daugiausia apėmė lipidų ir aterosklerozės, NF-κB, į rinkliavą panašių receptorių ir HIF-1 signalizacijos kelius. 1 receptas žymiai sumažino kreatinino ir karbamido azoto kiekį serume ir padidino NO ir NOS3 kiekį CRF žiurkių inkstų audiniuose. Išvada: 1 receptas parodo kelių komponentų ir kelių taikinių veikimo charakteristikas, o jo mechanizmas gali būti susijęs su joinkstų fibrozės slopinimas,prieš
uždegimas,žarnyno mikroekologijos gerinimas, irinkstų hipoksijos ir išemijos pagerėjimas.
 
Raktiniai žodžiai:lėtinis inkstų nepakankamumas; vaistų vartojimo reguliarumas; pagrindinis mechanizmas; duomenų gavyba; tinklo farmakologija; molekulinis prijungimas
Lėtinis inkstų nepakankamumas(CRF) yra auganti visuomenės sveikatos problema. Šiuo metu mano šalyje sergančiųjų LRF skaičius pasiekė 119 mln. Greitėjant gyvenimo tempui ir keičiantis mitybos struktūrai, pacientų skaičius kasmet vis didėja [1-2]. CRF būdingas negrįžtamas inkstų funkcijos pažeidimas, oksidacinis stresas ir uždegimas, galiausiai sukeliantis inkstų fibrozę. Ankstyvoje CRF stadijoje dauguma jų neturi ryškių klinikinių simptomų, o vėlyvoje stadijoje, padidėjus metabolinių toksinų kiekiui, dažnai pažeidžiami keli vidaus organai. Dėl veiksmingų gydymo galimybių trūkumo CRF turi didelį mirtingumą, o tai yra didelė našta šeimai ir visuomenei [3].
Tradicinė kinų medicina turi ilgą CRF gydymo istoriją, kuri gali veiksmingai palengvinti klinikinius simptomus ir sulėtinti inkstų funkcijos progresavimą, o tai turi unikalių pranašumų. Kalbant apie etiologiją ir patogenezę, Zou Yanqin mano, kad inkstų nepakankamumas yra pagrindinė CRF patogenezė, o drėgmė ir kraujo sąstingis yra pagrindinė patologija [4]; Zhang Xingping mano, kad inkstai yra gyvybingumo šaknis, o gyvybingumo trūkumas yra pagrindinė CRF priežastis [5]. Kalbant apie gydymo metodus, dauguma gydytojų pasisako už sindromo diferencijavimą ir gydymą. Zhang Daning suformulavo pagrindinius principus, kaip pagyvinti inkstus ir suaktyvinti kraujotaką, kad būtų pašalinta pagrindinė priežastis, o išsklaidyti drėgmę ir sumažinti nepageidaujamus reiškinius, siekiant gydyti simptomus[6]; Atsižvelgiant į geresnį gydomąjį poveikį [7]. Nors tradicinė kinų medicina

Cistanche-chronickidney disease-2(80)


Daug taikymo rezultatų pasiekta gydant CRF. Tačiau dėl sindromų standartizavimo stokos ir klinikinių receptų lankstumo sunku rasti pagrindines taisykles, o tai sukėlė didelių sunkumų paveldint ir naujoviškai plėtojant CRF. Todėl, norint ištirti tradicinės kinų medicinos gydymo taisykles gydant CRF, būtina naudoti duomenų gavybos metodus. Kinijos medicinos mokslų akademijos Kinijos Materia Medica instituto sukurta TCM paveldėjimo palaikymo platforma sudarė sąlygas pažinti ligų vystymąsi ir vaistų vartojimo dėsnius bei turi svarbią klinikinę vertę.
Jiujiang tradicinės kinų medicinos ligoninė, priklausanti Dziangsi tradicinės kinų medicinos universitetui, yra Nacionalinis tradicinės kinų medicinos inkstų ligų klinikinis centras. Vyriausiasis gydytojas Wu Zhaodong yra Nefrologijos skyriaus vadovas. Režisierius Wu Zhaodong sujungė savo ilgametę klinikinę patirtį, kad surinktų įvairias teorijas
Apskritai jis yra gana veiksmingas gydant CRF. Režisierius Wu Zhaodong mano, kad CRF patogenezę daugiausia lemia blužnies ir inkstų trūkumas, drumstumo ir toksinų kaupimasis bei qi judėjimo disbalansas. Kalbant apie gydymo metodus, anksčiau gydytojai CRF dažniausiai gydydavo inksto požiūriu, tačiau direktorius Wu Zhaodong naujoviškai pasisakė už tai, kad CRF būtų gydoma iš blužnies ir skrandžio, pagyvinant blužnį ir inkstus, maitinant įgytą prigimtį. įgimtas ir bendradarbiaujant reguliuojant qi kilimą ir kritimą, klinikinis poveikis dažnai būna dvigubai didesnis, įdedant perpus pastangų. Atitinkamai, šiame tyrime ketinama naudoti duomenų gavybos ir tinklo farmakologijos strategijas, pagrįstas direktoriaus Wu Zhaodongo ambulatorinių atvejų duomenimis, kad iš pradžių būtų galima ištirti jo klinikinę patirtį gydant CRF, ištirti pagrindinio naujo recepto poveikio mechanizmą ir pakloti tolesnio gydymo pagrindą. atlikti tyrimus.
 

1 Medžiagos ir metodai
1.1 Receptų šaltiniai Nuo 2019 m. liepos mėn. iki 2021 m. liepos mėn. direktorius Wu Zhaodong buvo atrinktas pirmiesiems ir tolesniems popieriniams CRF diagnostikos ir gydymo receptams Jiujiang tradicinės kinų medicinos ligoninėje išrašyti. Iš viso buvo patikrinta 200 popierinių receptų.
1.2. Medicininių įrašų įtraukimo kriterijai Žr. CRF diagnostikos kriterijus 2012 m. Amerikos inkstų ligų prognozės kokybės gairėse. Buvo atrinkti pacientai, kurių Ⅱ~Ⅴ stadija nebuvo dializuojama. Tie, kurie atitinka "inkstų nepakankamumo ligos" diagnozę tradicinėje kinų medicinoje, kurios pradžios laikas yra didesnis nei 6 mėnesiai ir vartoja tradicinės kinų medicinos nuovirą. Norėdami įvertinti gydymą kaip „veiksmingą“, žr. gydomojo poveikio vertinimo standartą [8].
1.3 Analizės programinė įranga „Tradicinės kinų medicinos paveldėjimo pagalbinė platforma (V2.5)“ programinę įrangą teikia Kinijos kinų medicinos mokslų akademijos Kinijos Materia Medica institutas. Programinė įranga turi algoritmus ir funkcijas, tokias kaip susiejimo taisyklės, klasterizacijos algoritmai ir dažnio statistika, ir gali būti naudojama įvesti, išsaugoti, analizuoti ir išgauti žinomų ir patyrusių kinų medicinos specialistų receptus.
1.4 Duomenų analizė Naudojant TCM paveldėjimo palaikymo platformos (V2.5) programinės įrangos duomenų analizės modulyje esančią receptų analizės funkciją, išaiškinamos vaistų vartojimo taisyklės, atliekama aukšto dažnio vaistų derinių analizė ir gaunamos galimos naujos receptinių derinių sekos. .
1.5 Naujo recepto derinio 1 sekos (toliau – naujas receptas 1) pagrindinių cheminių komponentų surinkimas ir patikrinimas buvo atliktas naudojant tradicinės kinų medicinos sisteminės farmakologijos (TCMSP) duomenų bazę ir analizės platformą bei tradicinės kinų medicinos molekulę. mechanizmo bioinformatikos analizės įrankis (http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/) nuskaito visus farmakodinaminius komponentus. Buvo atrinkti tie, kurių biologinis prieinamumas per burną (OB) yra didesnis arba lygus 30 proc., o panašumas į vaistą (DL) – didesnis arba lygus 0,18.

Cistanche-chronickidney disease-5(83)


Be to, buvo įtraukti ir komponentai, kurie nebuvo įtraukti į duomenų bazę, bet literatūroje buvo nurodyti kaip biologinis aktyvumas.

1.6 Galimi tikslai Tradicinės kinų medicinos sistemų farmakologijos duomenų bazės taikymas ir analizė
Visų „New Prescription 1“ veikliųjų medžiagų tiksliniai genai buvo gauti iš tradicinės kinų medicinos molekulinio mechanizmo bioinformatikos analizės įrankių duomenų bazės platformos, o veikliosios medžiagos ir taikinio sąveikos tinklas buvo sukurtas naudojant „Cytoscape 3.7.1“ programinę įrangą (https:/ /cytoscape.org/) .

1.7 CRF ligos tikslinė patikra Nustatykite paieškos terminą kaip „Lėtinis inkstų nepakankamumas“, ieškokite „GeneCards“ ir internetinėje žmogaus Mendelio genetinės duomenų bazės (OMIM, https://www.omim.org/), išsiaiškinkite CRF ligos taikinius ir ieškokite UniProt duomenų bazėje. (https://www.uniprot.org) Patikrinti taikiniai buvo normalizuoti lygiagrečiai, kad būtų gautas Šveicarijos Prot ID.

1.8 Naujosios formulės 1 ir CRF aktyviųjų komponentų bendras taikymas ir tinklo kūrimas Naujosios Formulės 1 ir CRF aktyvių komponentų bendras taikymas buvo gautas naudojant R ir Perl. Naudokite STRING, kad sukurtumėte bendro taikymo sąveikos tinklą.

1.9 Aktyvaus komponento-CRF tikslinio tinklo kūrimas Sąveikos tinklui sukurti naudokite Cytoscape 3.7.1 sujungimo papildinį.

1.10 Genų ontologija (GO) ir Kioto genų ir genomų enciklopedija (KEGG) Kelio analizė R GO.R paketas ir Perl buvo naudojami GO analizei. KEGG Pathway analizė buvo atlikta naudojant KEGG.R paketą. Išaiškinti galimą naujos formulės 1 biologinio poveikio mechanizmą gydant CRF.

1.11 Naujojo recepto 1 terapinio poveikio CRF žiurkėms įvertinimas. Buvo paimtos specifinės SD žiurkės be patogenų, sertifikato numeris SCXK (Xiang) 2021-0002, ir šį tyrimą patvirtino Jiangxi universiteto Eksperimentinių gyvūnų etikos peržiūros komitetas. Tradicinė kinų medicina, numeris JZLLSC2020026. Modelių grupės žiurkės buvo atsitiktinai suskirstytos į tuščiąją ir modelio grupę, o CRF modelis buvo paruoštas 5/6 nefrektomijos būdu. Specifinė operacija: žiurkės anestezuotos izofluranu, 1 cm į kairę pagrindinio stuburo pusę ir 0,5 cm į kairįjį šonkaulių lanką padarytas stuburui statmenas pjūvis. Steriliomis sąlygomis inksto kapsulė buvo bukais išpjaustyta, atidengtas kairysis inkstas, perrišta 2/3 kairiosios inksto arterijos, pilvas uždarytas ir susiūtas. Po septynių dienų buvo pašalintas dešinysis inkstas. Po 28 dienų žiurkių serumo kreatinino ir kraujo karbamido azoto kiekis buvo žymiai didesnis nei normalių žiurkių, o skirtumas buvo statistiškai reikšmingas, o tai rodo, kad modeliavimas buvo sėkmingas [9].
Žiurkės, kurių modeliavimas buvo sėkmingas, buvo atsitiktinai suskirstytos į modelių ir Xinfang 1 grupę, o Xinfang 1 grupei buvo duotas vaisto tirpalas pagal klinikinių kelių dozių sumą × 0,018 × 5 kartą per dieną 28 dienas iš eilės. Suleidus serumas buvo paimtas ir išsiųstas į ligoninės laboratorijų skyrių, kad būtų nustatytas kreatinino kiekis serume (kreatinino tyrimo rinkinys, Century World Company, partijos numeris R39120101) ir kraujo karbamido azoto (karbamido azoto tyrimo rinkinys, Century World Company). , partijos numeris 700300908). Inkstų audinys buvo paimtas, homogenizuotas ir pagal rinkinio instrukcijas buvo aptiktas azoto oksidas (NO, Nanjing Jiancheng Bioinžinerijos institutas, partijos numeris 20210605).
Endotelio azoto oksido sintazės (NOS) 3 (Shanghai Zeye Biotechnology Co., Ltd., partijos numeris 20210805) kiekis.

Cistanche-chronickidney disease-6(84)

rezultatas
2.1 Pirmajame recepte iš 200 receptų yra 217 tradicinių kinų vaistų, o 22 vaistai vartojami daugiau nei 40 kartų. 3 populiariausi vaistai yra Astragalus, Liuyuexue ir Smilax smilax. Žr. 1 lentelę.

news-859-738

2.2. Receptų reguliarumo analizė remiantis asociacijų taisyklių analize Pagal vaistų derinių dažnį pirmoje vietoje yra "Smilax, Liuyuexue", "Astragalus, Liuyuexue" ir "Smilax, Astragalus". Žr. 2 lentelę. Išanalizuotos gautų vaistų porų vaistų vartojimo taisyklės, o rezultatai pateikti 3 lentelėje. Asociacijos matuoklių tinklas parodytas 1 pav.

news-678-744

2.3 Senatvinės teisės analizė, pagrįsta entropijos klasterizavimu
2.3.1 The correlation degree analysis between drugs based on the improved mutual information method is based on the number of prescriptions, combined with experience judgment and pre-reading of data extracted from different parameters, setting the correlation degree to 6, the penalty degree to 2, and performing cluster analysis to obtain the For the degree of correlation between any two drugs, list the drug pairs with a correlation coefficient >0.05. Žr. 4 lentelę.

2.3.2 Naujų receptų, pagrįstų neprižiūrimu entropijos hierarchiniu klasterizavimu, analizė Remiantis pirmiau minėtu pagrindinių derinių išskyrimu, buvo gauti 8 nauji receptai, naudojant neprižiūrimą entropijos hierarchinį klasterizacijos algoritmą, kaip parodyta 5 lentelėje. 2 pav. naujo recepto tinklas ir naujo recepto vaistų tinklas.

2.4 Naujojo recepto 1 veikliųjų medžiagų patikra Per pirmiau minėtą duomenų bazę buvo paimtos naujojo recepto derinio 1 sekos veikliosios medžiagos, o rezultatai pateikti 6 lentelėje.

 

2.5. Surinkus ir tikrinant naujos formulės 1 18 biologiškai aktyvius ingredientus, buvo gauti iš viso 37 taikiniai (be pasikartojimo), tarp kurių svarbiausios pagrindinės sudedamosios dalys buvo -sitosterolis, stigmasterolis ir kt. Atitinkami komponentai ir taikinius, nustatyta, kad vienas aktyvus komponentas gali veikti kelis taikinius, pvz., -sitosterolis gali atitikti taikinius interleukiną (IL)-6, kraujagyslių endotelio augimo faktorių A (VEGFA), cisteino rūgštį asparto rūgšties proteolitinį fermentą (kaspazę) -3, NOS3, hipoksijos indukuojamas faktorius (HIF)-1, PON1, NR3C2; kelios veikliosios medžiagos taip pat gali veikti vieną taikinį kartu, pvz., -sitosterolis, stigmasterolis, izorhamnetinas, kvercetinas, kaempferolis
ir tt gali atitikti tikslinę NOS3; patvirtinta, kad Xinfang 1 vaidina bendrą vaidmenį su keliais tikslais ir keliais keliais.

news-348-743
Tau taip pat gali patikti